Antijen Tespiti
İki örnek şöyledir:
1. Lancefield gruplaması. Bir hücre duvarı grubu antijeni, bir enzim tarafından -haemolitik streptokoklardan ekstrakte edilir. Antijen daha sonra lateks partiküllerine bağlanan antiserumlar ile aglütinasyon yoluyla tespit edilir.
2. “O” ve “H” yazarak, hücre duvarı (O) antijenleri ve flagellar (H) antijenleri, organizmaların süspansiyonlarını bir slayt veya bir test tüpünde spesifik antiserumlarla karıştırarak Salmonella gibi Gram-negatif basillerde tespit edilir. Organizmaların kümelenmesiyle pozitif bir reaksiyon not edilir.
Karbonhidrat Metabolizması
Bir organizmanın glikoz gibi belirli şekerleri oksidatif (aerobik) veya fermentatif (oksijenden bağımsız) veya diğer karbonhidratları, ör. nişasta, tanımlamada yaygın olarak kullanılan yararlı bir özelliktir. Test, karbonhidrat içeren tanımlanmış bir ortam ve metabolik ürün için genellikle bir pH göstergesi olan bir algılama sistemi gerektirir.
Şeker kullanımı, laktoz fermente edici Enterobacteriaceae’yi laktoz fermente edici olmayan Enterobacteriaceae’den ayıran MacConkey agar ve sükrozu fermente eden Vibrio cholerae’yi tanımlayan tiyosülfat sitrat safra sükroz agarı (TCBS) gibi birincil izolasyon ortamına dahil edilebilir.
Diğer testler, organizmanın bir karbonhidratı tek bir karbon kaynağı olarak kullanma yeteneğini tespit eder, örn. sitrat kullanımı. Karbonhidrat panelleri, ticari kitlerde eş zamanlı olarak rahatlıkla test edilebilir.
Büyüme Faktörleri
Belirli bir ortamda bakteriyel büyüme için tanımlanan bileşiklerin mutlak gerekliliği, bir tanımlama aracı olarak kullanılır, örn. Haemophilus türleri, besin agarında üreme için kanda bulunan iki faktör olan X (hematin) ve V (difosfopiridin nükleotid) gereksinimlerinde farklılık gösterir. Sadece cinsin en önemli patojeni olan Haemophilus influenzae her ikisini de gerektirir.
Karbonhidrat metabolizması Biyokimya
Karbonhidrat metabolizması hastalıkları
Karbonhidrat METABOLİZMASI Biyokimya özet
Karbonhidrat metabolizması şeması
Karbonhidrat metabolizması ppt
Uzun süreli açlıkta karbonhidrat metabolizması
Karbonhidrat metabolizması biyokimya SORULARI
Karbonhidrat metabolizması makale
Protein Metabolizması
Bir bakteri türünün bir proteini veya bir amino asidi tanımlanmış bir ürüne metabolize etme yeteneği test edilir. Ürün için algılama sistemleri ve tanımlanmış bir ortama duyulan ihtiyaç, karbonhidrat kullanımı için gerekli olanlara benzerdir, örn. Enterobacteria ceae’nin farklı türlerinin yetenekleri farklılık gösterecektir: (a) jelatini sıvılaştırma; (b) amino asitleri dekarboksilat veya deaminat; (c) sülfür içeren amino asitlerden hidrojen sülfit üretmek; ve (d) triptofandan indol üretin. Bu testler genellikle ticari kitlerde gerçekleştirilir.
Duyarlılık Testleri
Bir türün bir bileşiğe duyarlılığı, sadece antibiyotik tedavisine karar vermek için değil, aynı zamanda tanımlamaya yardımcı olmak için de kullanılabilir. Yaygın olarak kullanılan iki örnek verilir, her ikisi de bileşiği içeren bir filtre kağıdı diskini bir kültür plakasına yerleştirerek, inkübe ederek ve ardından bir inhibisyon bölgesi gözlemleyerek test edilir.
1. Optochin testi. Streptococcus pneumoniae, optokine (etilhidrokuprein hidroklorür) duyarlıdır. Kanlı agarda buna benzeyen diğer streptokoklar dirençlidir.
2. Metronidazol hassasiyeti. Gerçek anaeroblar neredeyse her zaman bu antibiyotiğe duyarlıdır. Anaerobik olarak büyüyebilen aeroblar her zaman dirençlidir.
Toksin Üretimi
Bu önemli özellik, patojenleri patojenik olmayan türlerden ayırmaya yardımcı olabilir.
Örnekler:
1. Elek testi. Bu test toksin üreten (dolayısıyla patojenik) difteri nedeni olan Corynebakterium diphtheriae suşlarını patojenik olmayan suşlardan ayırmak için kullanılır. Difteri antitoksini içeren bir filtre kağıdı şeridi, tanımlanmış bir ortama yerleştirilir. Organizma, şeride dik açılarla agar üzerine serilir. İnkübasyondan sonra antijen (toksin) -antikor (antitoksin) komplekslerini temsil eden çökelti hatları görülebilir.
2. Sitotoksin. Antibiyotikle ilişkili diyare ile ilişkili Clostridium difficile suşları tarafından üretilen bir sitotoksin, hücre kültüründe antitoksin nötralizasyonu ile saptanabilir.
Ticari Kimlik Sistemleri
Patojenik bakterilerin hızlı bir şekilde tanımlanması için ticari sistemlerin geliştirilmesi, klinik bakteriologların yaşamını büyük ölçüde kolaylaştırmıştır. Piyasaya sürülmelerinden önce, her biyokimyasal testin bir test tüpü veya cam şişede ayrı ayrı kurulması gerekiyordu ve bu da etkileyici laboratuar cam eşyalarının sergilenmesine yol açıyordu.
Ticari sistemler, birçok biyokimyasal testin aynı anda saf bir kültürden yapılmasına izin verir. Elde edilen test sonuçlarının modeli daha sonra bilgisayarlı bir veri bankasında tutulan bilinen bakterilerden türetilen modellerle karşılaştırılır. Klinik izolatın olası kimliğini belirlemek için istatistiksel testler kullanılır.
Veri bankası, kimlik belirleme şüphesi varsa ek testler de önerebilir. Birleşik Krallık’ta yaygın olarak kullanılan sistemler, her ikisi de Bio Merieux (Bio Merieux UK Ltd, Basingstoke, İngiltere), BD Phoenix (BD Diagnostic Systems Europe, Le Pont de Claix, Fransa) ve Mastascan elite (Mast Group) tarafından üretilen API sistemi ve Vitek’tir.
- 1. API (görünen ve prosedür tanımlama) tanımlama sistemi. Bu sistem, çeşitli alt tabakalar ve plastik bir şerit üzerinde tutulan gösterge kimyasalları içeren plastik kaplardan oluşur. Her kupül, farklı bir biyokimyasal test içerir. İnkübasyondan sonra şeritteki her küpüle test organizmasının standart bir inokülüm eklenmesi, çıplak gözle okunabilen bir dizi renk değişikliği ile sonuçlanır. Elde edilen sonuçların modeli, veri bankası tarafından kolaylıkla deşifre edilebilir. Stafilokoklar, streptokoklar, korineform bakteriler, Enterobakteriler, anaeroblar ve fermente olmayan Gram-negatif bakterilerin tanımlanması için test panellerine sahip özelleştirilmiş şeritler mevcuttur.
- 2. Vitek ve BD Phoenix sistemleri. Bu sistemler benzer ilkeler kullanır. Biyokimyasal testler, bir plastik kart (Vitek) veya şerit (BD Phoenix) içine yerleştirilmiş kuyularda aynı anda gerçekleştirilir. Kuyucuklar, vakumlu emme (Vitek) veya dökme (BD Phoenix) yoluyla bakteriyel süspansiyonla doldurulur. İnkübasyondan sonra kartlar özelleştirilmiş, bilgisayar kontrollü bir okuyucu tarafından okunur ve sonuçlar bilgisayarlı uzman sistemler tarafından yorumlanır. Tıbbi önemi olan yaygın bakterileri tanımlamak için genellikle 4-6 saat içinde bir dizi kart üretilir. Bu sistemlerin avantajları arasında antibiyotik duyarlılık testi yapma yetenekleri, daha az operatör süresi gerektiren yarı otomasyon ve daha fazla laboratuvar güvenliği için kapalı bir sistem yer alır.
- 3. Mastascan seçkinleri. Bu sistem, Petri kaplarında tanımlama ortamının çok noktalı aşılanmasını kullanır. İnkübasyonun ardından plakalar, test ortamına dahil edilen tanımlama testlerini otomatik olarak okuyan ve yorumlayan bir okuyucuda analiz edilir. Sistem ayrıca antibiyotik duyarlılık testine ve plakların idrar örnekleriyle doğrudan aşılanmasına izin verir, böylece birincil idrar kültürü ihtiyacını ortadan kaldırır.